5月20日上午，蔡英文就任新一届台湾当局领导人，开始第二个任期。蔡英文在当天的就职演说中表示，“我们不会接受北京以“一国两制”矮化台湾，破坏台海的现状，这是我们坚定不移的原则。”
蔡英文在台北宾馆举办的就职仪式上发表的演说，对于关于两岸关系，完全没有提及“九二共识”四个字。
蔡英文称，“两岸关系正处于历史的转折点，双方都有责任，谋求长远相处之道，避免对立与分歧的扩大。在变局之中，我会坚守原则，并秉持解决问题的开放态度，负起责任，也期盼对岸领导人，能承担起相对的责任，共同稳定两岸关系的长远发展。”
蔡英文就职仪式上，还播放了几段危拉马拉、洪都拉斯和几位美国前政府官员的祝贺视频，以及宣读了来自美国国务卿蓬佩奥的贺信。
美国民主党总统参选人拜登在推特发文祝贺蔡英文连任，他称台湾蓬勃发展的民主制度和对新冠病毒疫情的应对，为世界树立了榜样。美国对台湾的支持必须是坚定的、有原则的及跨党合作的。
5月20日，中国外交部发言人赵立坚在例行记者会上表示，美国国务卿蓬佩奥发表声明祝贺台湾地区领导人蔡英文就职，将其称为所谓“总统”，并吹嘘美台“伙伴关系”。美国政府一些官员和美国一些政客向蔡英文发视频贺辞。美方上述举动严重违反一个中国原则和中美三个联合公报规定，严重干涉中国内政。中方对此表示强烈愤慨，并予以谴责。
赵立坚强调，中方敦促美方立即纠正错误，恪守一个中国原则和中美三个联合公报规定，停止美台官方往来和提升与台实质关系，停止干涉中国内政，停止任何损害台海和平稳定和中美关系的言行。中方将对美方上述错误行径采取必要应对措施，由此产生的后果应由美方承担。
5月20日，中国国台办发言人马晓光就民进党当局领导人“5·20”讲话中有关两岸关系内容应询表示，当前两岸关系形势复杂严峻。民进党当局拒不承认体现一个中国原则的“九二共识”，单方面破坏两岸关系和平发展的政治基础。
马晓光表示，我们有坚定的意志、充分的信心、足够的能力捍卫国家主权和领土完整，绝不容忍任何分裂国家的行为，绝不容忍任何外部势力干预中国内政。
马晓光还表示，我们愿意在坚持“九二共识”、反对“台独”的共同政治基础上，同台湾各党派、团体和人士加强交往，继续就两岸关系和民族未来开展对话协商，为推动两岸关系和平发展、推进祖国和平统一和实现中华民族伟大复兴而共同奋斗。