美国天主教对拜登就任总统的敌意和冷漠的态度，引起了宗教界人士和一些媒体的注意。拜登总统是美国历史上第二位当选美国最高政治职位的罗马天主教徒。拜登应该可以与进步派教皇方济各（Pope Francis）合作，逆转特朗普政府时代的许多应对气候变化和移民改革政策。
但有媒体人士认为，美国天主教会内部对拜登的支持似乎比较薄弱，以洛杉矶大主教何塞·戈麦斯 （Jose Gomez）为首的美国天主教主教会议甚至对拜登表示了敌意。在宗教和政治的交集中，天主教会保守派和进步派之间的分歧在美国最为严重，拜登的当选揭示了这一点。
华盛顿美国天主教大学（CUA）政治学教授约翰·怀特（John K. White）表示，一位天主教总统非但没有受到主教们的祝贺，没有说我们将共同努力，同时承认分歧，反而加深了分裂，这真是不可思议。
其分歧的根源在于天主教会中许多人反对堕胎和同性婚姻，而其他人则认为，教皇方济各倡导的对生命神圣性的更广泛解释，还应该包括气候变化、移民和消除贫困。
美国天主教的管理机构美国天主教主教会议在拜登1月20日宣誓就职时发表的声明说，对拜登的“虔诚”表示欢迎，却特别严厉指责了拜登对堕胎的支持。
美国天主教主教会议大会主席何塞·戈麦斯强调说：“我必须指出，我们的新总统已经承诺推行某些政策，这些政策将助长道德邪恶，威胁人类的生命和尊严，其中最严重的是在堕胎、避孕、婚姻和性别等领域。”
隶属于保守的天主事工会的戈麦斯继续重申，反对堕胎仍然是主教们的首要任务，并强调说：“当我们国家年复一年有近100万未出生的生命因堕胎而被抛弃时，我们不能保持沉默。”
在拜登当选后不久，天主教对其不满就更显而易见了。戈麦斯当时说，主教们在去年11月底的年度会议结束时，采取了罕见的步骤，成立了一个由他们的成员组成的“特别工作组”，与拜登一起“处理”“复杂和困难的局面”。
戈麦斯没有概述工作组将采取的哪些具体措施，但他表示，一位天主教总统倡导的容忍堕胎政策带来了一个特殊的问题，因为“它会在信众中造成混乱”。
虽然美国天主教主教会议大会对拜登就职总统表示出冷淡，但却在2017年欢迎了特朗普就任总统表示了欢迎。该教会的右翼分支与特朗普政府关系良好。前共和党众议院议长纽特·金里奇（Newt Gingrich）的妻子就获得了驻罗马教廷大使的美差。去年，就在特朗普政府的美国国务卿蓬佩奥访问罗马的几周前，他在一本反方济各的杂志上采取了不寻常的举措，批评梵蒂冈。教皇当时并不愿会见蓬佩奥。
罗马教会内部的裂痕持续了几十年，涉及1960年代的自由主义指导方针，后来的保守派教皇约翰·保罗二世（John Paul II ）和本笃十六世（Benedict XVI）否决了这些指导方针。方济各鼓吹回归进步的草根社会行动主义，以及一个更具包容性的教会。他提拔了像激进的红衣主教威尔顿·格雷戈里（Wilton Gregor）这样的主教，他是第一位成为红衣主教的美国黑人，但没有提拔像戈麦斯这样的右翼人士。
拜登的当选使天主教的分歧凸显出来。拜登的家乡在特拉华州威尔明顿的教区，在拜登竞选总统期间，有一些教会拒绝拜登参加圣餐会，还有一些保守的天主教领袖公开提出将78岁的拜登逐出教会。
华盛顿伦理与公共政策中心（EPPC）高级研究员、教皇约翰·保罗二世的保守派传记作者乔治·韦格尔（George Weigel）说，对教会来说，“这是一个相当重要的转折点”。“它明确了一个多年来积累起来的问题。”
韦格尔认为，天主教政客，包括拜登、民主党人众议院议长佩洛西和加州州长纽森，都因为支持堕胎而丧失了参加天主教圣餐会的权利。
韦格尔表示，“这与政治无关，这是教会的完整性。” 韦格尔还强调说，堕胎不同于其他问题，“不是每个问题都是平等的，这与气候变化、移民或税收无关。人类生命的神圣性，从受孕到自然死亡，是天主教自我理解中不容置疑的一部分。” 天主教会的其他人，尤其是美国人，对这个问题有不同的看法，而且看法更为广泛。